Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Podnl1Q6P3Y9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Podnl1Q6P3Y9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Podnl1Q6P3Y9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Podnl1Q6P3Y9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Podnl1Q6P3Y9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Podnl1Q6P3Y9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Podnl1Q6P3Y9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Podnl1Q6P3Y9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Podnl1Q6P3Y9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Podnl1Q6P3Y9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Podnl1Q6P3Y9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Podnl1Q6P3Y9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Podnl1Q6P3Y9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Podnl1Q6P3Y9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Podnl1Q6P3Y9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Podnl1Q6P3Y9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Podnl1Q6P3Y9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Podnl1Q6P3Y9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Podnl1Q6P3Y9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Podnl1Q6P3Y9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Podnl1Q6P3Y9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Podnl1Q6P3Y9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Podnl1Q6P3Y9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Podnl1Q6P3Y9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Podnl1Q6P3Y9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Podnl1Q6P3Y9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Podnl1Q6P3Y9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Podnl1Q6P3Y9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Podnl1Q6P3Y9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Podnl1Q6P3Y9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Podnl1Q6P3Y9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Podnl1Q6P3Y9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Podnl1Q6P3Y9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Podnl1Q6P3Y9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Podnl1Q6P3Y9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Podnl1Q6P3Y9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Podnl1Q6P3Y9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Podnl1Q6P3Y9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Podnl1Q6P3Y9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Podnl1Q6P3Y9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Podnl1Q6P3Y9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Podnl1Q6P3Y9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Podnl1Q6P3Y9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Podnl1Q6P3Y9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Podnl1Q6P3Y9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Podnl1Q6P3Y9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Podnl1Q6P3Y9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Podnl1Q6P3Y9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Podnl1Q6P3Y9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Podnl1Q6P3Y9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Podnl1Q6P3Y9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Podnl1Q6P3Y9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Podnl1Q6P3Y9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Podnl1Q6P3Y9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Podnl1Q6P3Y9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Podnl1Q6P3Y9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Podnl1Q6P3Y9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Podnl1Q6P3Y9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Podnl1Q6P3Y9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Podnl1Q6P3Y9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Podnl1Q6P3Y9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Podnl1Q6P3Y9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Podnl1Q6P3Y9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Podnl1Q6P3Y9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Podnl1Q6P3Y9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms