Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3E7

Hdac10, Histone deacetylase 10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac10Q6P3E7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hdac10Q6P3E7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hdac10Q6P3E7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hdac10Q6P3E7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hdac10Q6P3E7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hdac10Q6P3E7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hdac10Q6P3E7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Hdac10Q6P3E7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hdac10Q6P3E7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hdac10Q6P3E7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hdac10Q6P3E7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hdac10Q6P3E7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hdac10Q6P3E7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hdac10Q6P3E7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hdac10Q6P3E7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hdac10Q6P3E7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Hdac10Q6P3E7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hdac10Q6P3E7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hdac10Q6P3E7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hdac10Q6P3E7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hdac10Q6P3E7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hdac10Q6P3E7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hdac10Q6P3E7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hdac10Q6P3E7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hdac10Q6P3E7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hdac10Q6P3E7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hdac10Q6P3E7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hdac10Q6P3E7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hdac10Q6P3E7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hdac10Q6P3E7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hdac10Q6P3E7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hdac10Q6P3E7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hdac10Q6P3E7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hdac10Q6P3E7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hdac10Q6P3E7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hdac10Q6P3E7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hdac10Q6P3E7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hdac10Q6P3E7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hdac10Q6P3E7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hdac10Q6P3E7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hdac10Q6P3E7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hdac10Q6P3E7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hdac10Q6P3E7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hdac10Q6P3E7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hdac10Q6P3E7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hdac10Q6P3E7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hdac10Q6P3E7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hdac10Q6P3E7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hdac10Q6P3E7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hdac10Q6P3E7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hdac10Q6P3E7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms