Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrimpolQ6P1E7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrimpolQ6P1E7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrimpolQ6P1E7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrimpolQ6P1E7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrimpolQ6P1E7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrimpolQ6P1E7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrimpolQ6P1E7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrimpolQ6P1E7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrimpolQ6P1E7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrimpolQ6P1E7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrimpolQ6P1E7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrimpolQ6P1E7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrimpolQ6P1E7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrimpolQ6P1E7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PrimpolQ6P1E7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrimpolQ6P1E7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrimpolQ6P1E7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrimpolQ6P1E7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrimpolQ6P1E7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrimpolQ6P1E7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrimpolQ6P1E7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrimpolQ6P1E7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrimpolQ6P1E7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrimpolQ6P1E7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrimpolQ6P1E7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrimpolQ6P1E7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrimpolQ6P1E7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrimpolQ6P1E7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrimpolQ6P1E7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrimpolQ6P1E7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrimpolQ6P1E7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrimpolQ6P1E7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrimpolQ6P1E7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrimpolQ6P1E7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrimpolQ6P1E7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrimpolQ6P1E7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrimpolQ6P1E7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrimpolQ6P1E7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrimpolQ6P1E7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrimpolQ6P1E7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrimpolQ6P1E7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PrimpolQ6P1E7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrimpolQ6P1E7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrimpolQ6P1E7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrimpolQ6P1E7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrimpolQ6P1E7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrimpolQ6P1E7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrimpolQ6P1E7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrimpolQ6P1E7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PrimpolQ6P1E7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrimpolQ6P1E7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrimpolQ6P1E7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrimpolQ6P1E7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms