Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Slx4Q6P1D7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Slx4Q6P1D7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Slx4Q6P1D7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Slx4Q6P1D7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Slx4Q6P1D7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Slx4Q6P1D7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Slx4Q6P1D7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Slx4Q6P1D7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Slx4Q6P1D7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Slx4Q6P1D7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Slx4Q6P1D7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Slx4Q6P1D7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Slx4Q6P1D7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Slx4Q6P1D7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Slx4Q6P1D7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Slx4Q6P1D7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Slx4Q6P1D7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Slx4Q6P1D7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Slx4Q6P1D7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Slx4Q6P1D7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Slx4Q6P1D7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Slx4Q6P1D7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Slx4Q6P1D7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Slx4Q6P1D7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Slx4Q6P1D7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Slx4Q6P1D7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Slx4Q6P1D7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Slx4Q6P1D7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Slx4Q6P1D7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Slx4Q6P1D7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Slx4Q6P1D7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Slx4Q6P1D7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Slx4Q6P1D7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Slx4Q6P1D7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Slx4Q6P1D7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms