Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1C6

Lrig3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig3Q6P1C6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrig3Q6P1C6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrig3Q6P1C6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrig3Q6P1C6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrig3Q6P1C6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrig3Q6P1C6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrig3Q6P1C6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrig3Q6P1C6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrig3Q6P1C6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrig3Q6P1C6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrig3Q6P1C6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrig3Q6P1C6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrig3Q6P1C6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrig3Q6P1C6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrig3Q6P1C6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrig3Q6P1C6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrig3Q6P1C6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrig3Q6P1C6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrig3Q6P1C6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrig3Q6P1C6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrig3Q6P1C6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrig3Q6P1C6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrig3Q6P1C6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lrig3Q6P1C6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lrig3Q6P1C6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lrig3Q6P1C6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrig3Q6P1C6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms