Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms