Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pdcd11Q6NS46 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pdcd11Q6NS46 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pdcd11Q6NS46 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pdcd11Q6NS46 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pdcd11Q6NS46 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pdcd11Q6NS46 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pdcd11Q6NS46 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pdcd11Q6NS46 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pdcd11Q6NS46 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pdcd11Q6NS46 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pdcd11Q6NS46 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pdcd11Q6NS46 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pdcd11Q6NS46 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pdcd11Q6NS46 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pdcd11Q6NS46 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pdcd11Q6NS46 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pdcd11Q6NS46 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pdcd11Q6NS46 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pdcd11Q6NS46 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Pdcd11Q6NS46 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Pdcd11Q6NS46 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Pdcd11Q6NS46 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pdcd11Q6NS46 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pdcd11Q6NS46 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pdcd11Q6NS46 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Pdcd11Q6NS46 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pdcd11Q6NS46 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pdcd11Q6NS46 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pdcd11Q6NS46 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pdcd11Q6NS46 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pdcd11Q6NS46 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pdcd11Q6NS46 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pdcd11Q6NS46 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pdcd11Q6NS46 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pdcd11Q6NS46 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pdcd11Q6NS46 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pdcd11Q6NS46 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pdcd11Q6NS46 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pdcd11Q6NS46 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Pdcd11Q6NS46 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pdcd11Q6NS46 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pdcd11Q6NS46 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pdcd11Q6NS46 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pdcd11Q6NS46 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pdcd11Q6NS46 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pdcd11Q6NS46 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pdcd11Q6NS46 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pdcd11Q6NS46 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pdcd11Q6NS46 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pdcd11Q6NS46 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pdcd11Q6NS46 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pdcd11Q6NS46 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pdcd11Q6NS46 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Pdcd11Q6NS46 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pdcd11Q6NS46 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pdcd11Q6NS46 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pdcd11Q6NS46 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pdcd11Q6NS46 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pdcd11Q6NS46 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pdcd11Q6NS46 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pdcd11Q6NS46 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pdcd11Q6NS46 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pdcd11Q6NS46 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pdcd11Q6NS46 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pdcd11Q6NS46 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pdcd11Q6NS46 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pdcd11Q6NS46 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pdcd11Q6NS46 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pdcd11Q6NS46 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pdcd11Q6NS46 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pdcd11Q6NS46 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pdcd11Q6NS46 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pdcd11Q6NS46 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pdcd11Q6NS46 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pdcd11Q6NS46 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pdcd11Q6NS46 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Pdcd11Q6NS46 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Pdcd11Q6NS46 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Pdcd11Q6NS46 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Pdcd11Q6NS46 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Pdcd11Q6NS46 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pdcd11Q6NS46 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pdcd11Q6NS46 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pdcd11Q6NS46 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pdcd11Q6NS46 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Pdcd11Q6NS46 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pdcd11Q6NS46 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pdcd11Q6NS46 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pdcd11Q6NS46 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pdcd11Q6NS46 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pdcd11Q6NS46 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pdcd11Q6NS46 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pdcd11Q6NS46 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pdcd11Q6NS46 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pdcd11Q6NS46 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pdcd11Q6NS46 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pdcd11Q6NS46 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pdcd11Q6NS46 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pdcd11Q6NS46 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms