Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc66Q6NS45 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms