Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQU0

UPF0524 protein C3orf70 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6GQU0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Q6GQU0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q6GQU0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q6GQU0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q6GQU0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q6GQU0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q6GQU0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Q6GQU0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q6GQU0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q6GQU0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q6GQU0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Q6GQU0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q6GQU0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q6GQU0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q6GQU0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q6GQU0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.6 ms