Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdzrn3Q69ZS0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdzrn3Q69ZS0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pdzrn3Q69ZS0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pdzrn3Q69ZS0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pdzrn3Q69ZS0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pdzrn3Q69ZS0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pdzrn3Q69ZS0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Pdzrn3Q69ZS0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pdzrn3Q69ZS0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pdzrn3Q69ZS0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pdzrn3Q69ZS0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pdzrn3Q69ZS0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdzrn3Q69ZS0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdzrn3Q69ZS0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdzrn3Q69ZS0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdzrn3Q69ZS0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdzrn3Q69ZS0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdzrn3Q69ZS0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdzrn3Q69ZS0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdzrn3Q69ZS0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdzrn3Q69ZS0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdzrn3Q69ZS0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdzrn3Q69ZS0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdzrn3Q69ZS0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdzrn3Q69ZS0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdzrn3Q69ZS0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdzrn3Q69ZS0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdzrn3Q69ZS0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdzrn3Q69ZS0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms