Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB8

Zcchc2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc2Q69ZB8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zcchc2Q69ZB8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zcchc2Q69ZB8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zcchc2Q69ZB8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zcchc2Q69ZB8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zcchc2Q69ZB8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zcchc2Q69ZB8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zcchc2Q69ZB8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zcchc2Q69ZB8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zcchc2Q69ZB8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zcchc2Q69ZB8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Zcchc2Q69ZB8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zcchc2Q69ZB8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zcchc2Q69ZB8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zcchc2Q69ZB8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zcchc2Q69ZB8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Zcchc2Q69ZB8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zcchc2Q69ZB8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zcchc2Q69ZB8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zcchc2Q69ZB8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zcchc2Q69ZB8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zcchc2Q69ZB8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zcchc2Q69ZB8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zcchc2Q69ZB8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zcchc2Q69ZB8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zcchc2Q69ZB8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zcchc2Q69ZB8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zcchc2Q69ZB8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zcchc2Q69ZB8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zcchc2Q69ZB8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zcchc2Q69ZB8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zcchc2Q69ZB8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zcchc2Q69ZB8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zcchc2Q69ZB8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zcchc2Q69ZB8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zcchc2Q69ZB8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zcchc2Q69ZB8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zcchc2Q69ZB8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zcchc2Q69ZB8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zcchc2Q69ZB8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zcchc2Q69ZB8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zcchc2Q69ZB8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zcchc2Q69ZB8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zcchc2Q69ZB8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zcchc2Q69ZB8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Zcchc2Q69ZB8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zcchc2Q69ZB8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zcchc2Q69ZB8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zcchc2Q69ZB8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zcchc2Q69ZB8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zcchc2Q69ZB8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zcchc2Q69ZB8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Zcchc2Q69ZB8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zcchc2Q69ZB8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zcchc2Q69ZB8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zcchc2Q69ZB8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zcchc2Q69ZB8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zcchc2Q69ZB8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zcchc2Q69ZB8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zcchc2Q69ZB8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zcchc2Q69ZB8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zcchc2Q69ZB8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms