Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cdk13Q69ZA1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cdk13Q69ZA1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
Cdk13Q69ZA1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdk13Q69ZA1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdk13Q69ZA1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdk13Q69ZA1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdk13Q69ZA1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdk13Q69ZA1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdk13Q69ZA1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdk13Q69ZA1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdk13Q69ZA1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdk13Q69ZA1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdk13Q69ZA1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdk13Q69ZA1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdk13Q69ZA1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdk13Q69ZA1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdk13Q69ZA1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdk13Q69ZA1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdk13Q69ZA1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdk13Q69ZA1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdk13Q69ZA1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdk13Q69ZA1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdk13Q69ZA1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdk13Q69ZA1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdk13Q69ZA1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdk13Q69ZA1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdk13Q69ZA1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdk13Q69ZA1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdk13Q69ZA1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdk13Q69ZA1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdk13Q69ZA1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdk13Q69ZA1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdk13Q69ZA1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdk13Q69ZA1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdk13Q69ZA1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdk13Q69ZA1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdk13Q69ZA1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdk13Q69ZA1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdk13Q69ZA1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdk13Q69ZA1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdk13Q69ZA1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdk13Q69ZA1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdk13Q69ZA1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdk13Q69ZA1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdk13Q69ZA1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdk13Q69ZA1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdk13Q69ZA1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdk13Q69ZA1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdk13Q69ZA1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdk13Q69ZA1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdk13Q69ZA1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdk13Q69ZA1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdk13Q69ZA1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdk13Q69ZA1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdk13Q69ZA1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdk13Q69ZA1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdk13Q69ZA1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdk13Q69ZA1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdk13Q69ZA1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdk13Q69ZA1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdk13Q69ZA1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Cdk13Q69ZA1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Cdk13Q69ZA1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Cdk13Q69ZA1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Cdk13Q69ZA1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cdk13Q69ZA1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cdk13Q69ZA1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cdk13Q69ZA1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cdk13Q69ZA1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cdk13Q69ZA1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdk13Q69ZA1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdk13Q69ZA1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdk13Q69ZA1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdk13Q69ZA1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdk13Q69ZA1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdk13Q69ZA1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdk13Q69ZA1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdk13Q69ZA1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdk13Q69ZA1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdk13Q69ZA1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdk13Q69ZA1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdk13Q69ZA1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdk13Q69ZA1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdk13Q69ZA1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdk13Q69ZA1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdk13Q69ZA1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdk13Q69ZA1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdk13Q69ZA1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdk13Q69ZA1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdk13Q69ZA1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdk13Q69ZA1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdk13Q69ZA1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdk13Q69ZA1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdk13Q69ZA1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdk13Q69ZA1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdk13Q69ZA1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdk13Q69ZA1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdk13Q69ZA1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdk13Q69ZA1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms