Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE8

Znf280d, Zinc finger protein 280D, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf280dQ68FE8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Znf280dQ68FE8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Znf280dQ68FE8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Znf280dQ68FE8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Znf280dQ68FE8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Znf280dQ68FE8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Znf280dQ68FE8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Znf280dQ68FE8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Znf280dQ68FE8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Znf280dQ68FE8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Znf280dQ68FE8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Znf280dQ68FE8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Znf280dQ68FE8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Znf280dQ68FE8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Znf280dQ68FE8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Znf280dQ68FE8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Znf280dQ68FE8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Znf280dQ68FE8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Znf280dQ68FE8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Znf280dQ68FE8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Znf280dQ68FE8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Znf280dQ68FE8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Znf280dQ68FE8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Znf280dQ68FE8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Znf280dQ68FE8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Znf280dQ68FE8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Znf280dQ68FE8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Znf280dQ68FE8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Znf280dQ68FE8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Znf280dQ68FE8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms