Protein–RNA interactions for Protein: Q64727

Vcl, Vinculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VclQ64727 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VclQ64727 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VclQ64727 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VclQ64727 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
VclQ64727 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VclQ64727 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VclQ64727 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VclQ64727 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VclQ64727 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VclQ64727 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VclQ64727 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VclQ64727 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VclQ64727 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VclQ64727 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VclQ64727 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VclQ64727 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VclQ64727 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VclQ64727 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VclQ64727 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VclQ64727 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VclQ64727 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VclQ64727 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VclQ64727 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VclQ64727 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
VclQ64727 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VclQ64727 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VclQ64727 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VclQ64727 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VclQ64727 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VclQ64727 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VclQ64727 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VclQ64727 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VclQ64727 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VclQ64727 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VclQ64727 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VclQ64727 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VclQ64727 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VclQ64727 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VclQ64727 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VclQ64727 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VclQ64727 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VclQ64727 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VclQ64727 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VclQ64727 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VclQ64727 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VclQ64727 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VclQ64727 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VclQ64727 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VclQ64727 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VclQ64727 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VclQ64727 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VclQ64727 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VclQ64727 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VclQ64727 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VclQ64727 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VclQ64727 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VclQ64727 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VclQ64727 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VclQ64727 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VclQ64727 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VclQ64727 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VclQ64727 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VclQ64727 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VclQ64727 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VclQ64727 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VclQ64727 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VclQ64727 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VclQ64727 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VclQ64727 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VclQ64727 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VclQ64727 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VclQ64727 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VclQ64727 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VclQ64727 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VclQ64727 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VclQ64727 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VclQ64727 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VclQ64727 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VclQ64727 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VclQ64727 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VclQ64727 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VclQ64727 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
VclQ64727 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VclQ64727 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VclQ64727 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VclQ64727 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VclQ64727 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VclQ64727 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VclQ64727 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VclQ64727 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VclQ64727 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VclQ64727 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VclQ64727 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VclQ64727 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VclQ64727 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VclQ64727 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VclQ64727 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VclQ64727 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VclQ64727 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VclQ64727 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms