Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Top2bQ64511 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Top2bQ64511 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Top2bQ64511 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Top2bQ64511 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Top2bQ64511 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Top2bQ64511 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Top2bQ64511 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Top2bQ64511 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Top2bQ64511 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Top2bQ64511 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Top2bQ64511 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.66
Top2bQ64511 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Top2bQ64511 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Top2bQ64511 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Top2bQ64511 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Top2bQ64511 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Top2bQ64511 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Top2bQ64511 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Top2bQ64511 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Top2bQ64511 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Top2bQ64511 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Top2bQ64511 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Top2bQ64511 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Top2bQ64511 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Top2bQ64511 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Top2bQ64511 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Top2bQ64511 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Top2bQ64511 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Top2bQ64511 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Top2bQ64511 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Top2bQ64511 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Top2bQ64511 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Top2bQ64511 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Top2bQ64511 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Top2bQ64511 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
Top2bQ64511 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
Top2bQ64511 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Top2bQ64511 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Top2bQ64511 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Top2bQ64511 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Top2bQ64511 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Top2bQ64511 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Top2bQ64511 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Top2bQ64511 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Top2bQ64511 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Top2bQ64511 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Top2bQ64511 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Top2bQ64511 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Top2bQ64511 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Top2bQ64511 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Top2bQ64511 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
Top2bQ64511 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Top2bQ64511 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Top2bQ64511 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Top2bQ64511 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Top2bQ64511 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Top2bQ64511 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Top2bQ64511 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Top2bQ64511 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Top2bQ64511 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Top2bQ64511 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Top2bQ64511 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Top2bQ64511 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Top2bQ64511 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
Top2bQ64511 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Top2bQ64511 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Top2bQ64511 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Top2bQ64511 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Top2bQ64511 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Top2bQ64511 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Top2bQ64511 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Top2bQ64511 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Top2bQ64511 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Top2bQ64511 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Top2bQ64511 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Top2bQ64511 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Top2bQ64511 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Top2bQ64511 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Top2bQ64511 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Top2bQ64511 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Top2bQ64511 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Top2bQ64511 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Top2bQ64511 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Top2bQ64511 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Top2bQ64511 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Top2bQ64511 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Top2bQ64511 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Top2bQ64511 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
Top2bQ64511 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Top2bQ64511 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Top2bQ64511 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Top2bQ64511 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Top2bQ64511 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Top2bQ64511 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Top2bQ64511 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Top2bQ64511 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Top2bQ64511 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
Top2bQ64511 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
Top2bQ64511 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms