Protein–RNA interactions for Protein: Q64253

Ly6e, Lymphocyte antigen 6E, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6eQ64253 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ly6eQ64253 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ly6eQ64253 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ly6eQ64253 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ly6eQ64253 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ly6eQ64253 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ly6eQ64253 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ly6eQ64253 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ly6eQ64253 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ly6eQ64253 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ly6eQ64253 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ly6eQ64253 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ly6eQ64253 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ly6eQ64253 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ly6eQ64253 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ly6eQ64253 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ly6eQ64253 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6eQ64253 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6eQ64253 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6eQ64253 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6eQ64253 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6eQ64253 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6eQ64253 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6eQ64253 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6eQ64253 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6eQ64253 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6eQ64253 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6eQ64253 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6eQ64253 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6eQ64253 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6eQ64253 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6eQ64253 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6eQ64253 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6eQ64253 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ly6eQ64253 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ly6eQ64253 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ly6eQ64253 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ly6eQ64253 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ly6eQ64253 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ly6eQ64253 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ly6eQ64253 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ly6eQ64253 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ly6eQ64253 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ly6eQ64253 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ly6eQ64253 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms