Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ccdc18Q640L5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ccdc18Q640L5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Ccdc18Q640L5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Ccdc18Q640L5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Ccdc18Q640L5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Ccdc18Q640L5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Ccdc18Q640L5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
Ccdc18Q640L5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ccdc18Q640L5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ccdc18Q640L5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ccdc18Q640L5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ccdc18Q640L5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ccdc18Q640L5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ccdc18Q640L5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ccdc18Q640L5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Ccdc18Q640L5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ccdc18Q640L5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Ccdc18Q640L5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ccdc18Q640L5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ccdc18Q640L5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ccdc18Q640L5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ccdc18Q640L5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ccdc18Q640L5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ccdc18Q640L5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ccdc18Q640L5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ccdc18Q640L5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ccdc18Q640L5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ccdc18Q640L5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ccdc18Q640L5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ccdc18Q640L5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ccdc18Q640L5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ccdc18Q640L5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ccdc18Q640L5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ccdc18Q640L5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ccdc18Q640L5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ccdc18Q640L5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ccdc18Q640L5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ccdc18Q640L5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ccdc18Q640L5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ccdc18Q640L5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ccdc18Q640L5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ccdc18Q640L5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ccdc18Q640L5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ccdc18Q640L5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
Ccdc18Q640L5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ccdc18Q640L5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ccdc18Q640L5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
Ccdc18Q640L5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ccdc18Q640L5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ccdc18Q640L5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ccdc18Q640L5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ccdc18Q640L5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ccdc18Q640L5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ccdc18Q640L5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ccdc18Q640L5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ccdc18Q640L5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ccdc18Q640L5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ccdc18Q640L5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Ccdc18Q640L5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ccdc18Q640L5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ccdc18Q640L5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ccdc18Q640L5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ccdc18Q640L5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ccdc18Q640L5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ccdc18Q640L5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ccdc18Q640L5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Ccdc18Q640L5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Ccdc18Q640L5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ccdc18Q640L5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Ccdc18Q640L5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Ccdc18Q640L5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Ccdc18Q640L5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ccdc18Q640L5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ccdc18Q640L5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ccdc18Q640L5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ccdc18Q640L5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ccdc18Q640L5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ccdc18Q640L5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ccdc18Q640L5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ccdc18Q640L5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ccdc18Q640L5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ccdc18Q640L5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ccdc18Q640L5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ccdc18Q640L5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ccdc18Q640L5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ccdc18Q640L5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ccdc18Q640L5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ccdc18Q640L5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
Ccdc18Q640L5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ccdc18Q640L5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ccdc18Q640L5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ccdc18Q640L5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ccdc18Q640L5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ccdc18Q640L5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ccdc18Q640L5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ccdc18Q640L5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ccdc18Q640L5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ccdc18Q640L5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ccdc18Q640L5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
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