Protein–RNA interactions for Protein: Q62520

Zic2, Zinc finger protein ZIC 2, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic2Q62520 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zic2Q62520 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zic2Q62520 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zic2Q62520 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zic2Q62520 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zic2Q62520 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zic2Q62520 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zic2Q62520 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zic2Q62520 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zic2Q62520 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zic2Q62520 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zic2Q62520 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zic2Q62520 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Zic2Q62520 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zic2Q62520 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zic2Q62520 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zic2Q62520 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zic2Q62520 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zic2Q62520 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zic2Q62520 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zic2Q62520 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zic2Q62520 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zic2Q62520 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zic2Q62520 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zic2Q62520 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zic2Q62520 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zic2Q62520 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zic2Q62520 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zic2Q62520 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zic2Q62520 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zic2Q62520 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zic2Q62520 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zic2Q62520 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Zic2Q62520 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zic2Q62520 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zic2Q62520 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Zic2Q62520 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zic2Q62520 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zic2Q62520 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zic2Q62520 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Zic2Q62520 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zic2Q62520 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zic2Q62520 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zic2Q62520 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zic2Q62520 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms