Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vil1Q62468 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vil1Q62468 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vil1Q62468 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vil1Q62468 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Vil1Q62468 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vil1Q62468 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vil1Q62468 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vil1Q62468 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vil1Q62468 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vil1Q62468 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vil1Q62468 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vil1Q62468 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vil1Q62468 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vil1Q62468 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vil1Q62468 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vil1Q62468 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vil1Q62468 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vil1Q62468 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Vil1Q62468 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vil1Q62468 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vil1Q62468 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vil1Q62468 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vil1Q62468 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vil1Q62468 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vil1Q62468 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Vil1Q62468 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vil1Q62468 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vil1Q62468 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vil1Q62468 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vil1Q62468 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vil1Q62468 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vil1Q62468 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vil1Q62468 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vil1Q62468 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Vil1Q62468 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Vil1Q62468 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vil1Q62468 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vil1Q62468 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vil1Q62468 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vil1Q62468 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vil1Q62468 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vil1Q62468 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vil1Q62468 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vil1Q62468 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vil1Q62468 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vil1Q62468 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vil1Q62468 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vil1Q62468 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vil1Q62468 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms