Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vat1Q62465 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms