Protein–RNA interactions for Protein: Q62460

Gm20865, (clone BALB3N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20865Q62460 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20865Q62460 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20865Q62460 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms