Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sp4Q62445 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms