Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp1Q62442 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp1Q62442 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms