Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms