Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Supt6hQ62383 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Supt6hQ62383 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Supt6hQ62383 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Supt6hQ62383 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Supt6hQ62383 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Supt6hQ62383 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Supt6hQ62383 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Supt6hQ62383 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Supt6hQ62383 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Supt6hQ62383 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Supt6hQ62383 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Supt6hQ62383 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Supt6hQ62383 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Supt6hQ62383 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Supt6hQ62383 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Supt6hQ62383 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Supt6hQ62383 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Supt6hQ62383 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Supt6hQ62383 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Supt6hQ62383 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Supt6hQ62383 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Supt6hQ62383 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Supt6hQ62383 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Supt6hQ62383 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Supt6hQ62383 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Supt6hQ62383 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Supt6hQ62383 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Supt6hQ62383 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Supt6hQ62383 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Supt6hQ62383 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Supt6hQ62383 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Supt6hQ62383 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Supt6hQ62383 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Supt6hQ62383 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Supt6hQ62383 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Supt6hQ62383 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Supt6hQ62383 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Supt6hQ62383 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Supt6hQ62383 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Supt6hQ62383 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Supt6hQ62383 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Supt6hQ62383 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Supt6hQ62383 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Supt6hQ62383 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Supt6hQ62383 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Supt6hQ62383 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Supt6hQ62383 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Supt6hQ62383 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Supt6hQ62383 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Supt6hQ62383 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Supt6hQ62383 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Supt6hQ62383 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Supt6hQ62383 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Supt6hQ62383 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Supt6hQ62383 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Supt6hQ62383 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Supt6hQ62383 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Supt6hQ62383 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Supt6hQ62383 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Supt6hQ62383 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Supt6hQ62383 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Supt6hQ62383 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Supt6hQ62383 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Supt6hQ62383 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Supt6hQ62383 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Supt6hQ62383 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Supt6hQ62383 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Supt6hQ62383 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Supt6hQ62383 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Supt6hQ62383 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Supt6hQ62383 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Supt6hQ62383 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Supt6hQ62383 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Supt6hQ62383 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Supt6hQ62383 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Supt6hQ62383 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Supt6hQ62383 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Supt6hQ62383 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Supt6hQ62383 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Supt6hQ62383 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Supt6hQ62383 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Supt6hQ62383 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Supt6hQ62383 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Supt6hQ62383 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Supt6hQ62383 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Supt6hQ62383 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Supt6hQ62383 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Supt6hQ62383 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Supt6hQ62383 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Supt6hQ62383 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Supt6hQ62383 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Supt6hQ62383 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Supt6hQ62383 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Supt6hQ62383 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Supt6hQ62383 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Supt6hQ62383 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Supt6hQ62383 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Supt6hQ62383 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Supt6hQ62383 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms