Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim28Q62318 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim28Q62318 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim28Q62318 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim28Q62318 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim28Q62318 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim28Q62318 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim28Q62318 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim28Q62318 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim28Q62318 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim28Q62318 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim28Q62318 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim28Q62318 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim28Q62318 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim28Q62318 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim28Q62318 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim28Q62318 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim28Q62318 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim28Q62318 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim28Q62318 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim28Q62318 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim28Q62318 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim28Q62318 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim28Q62318 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim28Q62318 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim28Q62318 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim28Q62318 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim28Q62318 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim28Q62318 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim28Q62318 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim28Q62318 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim28Q62318 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim28Q62318 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim28Q62318 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim28Q62318 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim28Q62318 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim28Q62318 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim28Q62318 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim28Q62318 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim28Q62318 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim28Q62318 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim28Q62318 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim28Q62318 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim28Q62318 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim28Q62318 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim28Q62318 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim28Q62318 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim28Q62318 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim28Q62318 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim28Q62318 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim28Q62318 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim28Q62318 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim28Q62318 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim28Q62318 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim28Q62318 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim28Q62318 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim28Q62318 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim28Q62318 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim28Q62318 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim28Q62318 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim28Q62318 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim28Q62318 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim28Q62318 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim28Q62318 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim28Q62318 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim28Q62318 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim28Q62318 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim28Q62318 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim28Q62318 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim28Q62318 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim28Q62318 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim28Q62318 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim28Q62318 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim28Q62318 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim28Q62318 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim28Q62318 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim28Q62318 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim28Q62318 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim28Q62318 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim28Q62318 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim28Q62318 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim28Q62318 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim28Q62318 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim28Q62318 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim28Q62318 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trim28Q62318 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trim28Q62318 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Trim28Q62318 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trim28Q62318 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim28Q62318 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim28Q62318 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim28Q62318 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim28Q62318 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim28Q62318 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim28Q62318 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim28Q62318 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim28Q62318 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim28Q62318 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim28Q62318 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim28Q62318 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim28Q62318 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
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