Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Ss18Q62280 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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