Protein–RNA interactions for Protein: Q62249

Sox19, Protein SOX-19 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox19Q62249 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox19Q62249 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sox19Q62249 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox19Q62249 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox19Q62249 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox19Q62249 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms