Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Kdm5dQ62240 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Kdm5dQ62240 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Kdm5dQ62240 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Kdm5dQ62240 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
Kdm5dQ62240 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Kdm5dQ62240 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Kdm5dQ62240 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
Kdm5dQ62240 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Kdm5dQ62240 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Kdm5dQ62240 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Kdm5dQ62240 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Kdm5dQ62240 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Kdm5dQ62240 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Kdm5dQ62240 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Kdm5dQ62240 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Kdm5dQ62240 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Kdm5dQ62240 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Kdm5dQ62240 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Kdm5dQ62240 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Kdm5dQ62240 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Kdm5dQ62240 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Kdm5dQ62240 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Kdm5dQ62240 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Kdm5dQ62240 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Kdm5dQ62240 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Kdm5dQ62240 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Kdm5dQ62240 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Kdm5dQ62240 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Kdm5dQ62240 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Kdm5dQ62240 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Kdm5dQ62240 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Kdm5dQ62240 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Kdm5dQ62240 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Kdm5dQ62240 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Kdm5dQ62240 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Kdm5dQ62240 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Kdm5dQ62240 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Kdm5dQ62240 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Kdm5dQ62240 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Kdm5dQ62240 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Kdm5dQ62240 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Kdm5dQ62240 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
Kdm5dQ62240 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Kdm5dQ62240 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Kdm5dQ62240 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Kdm5dQ62240 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Kdm5dQ62240 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
Kdm5dQ62240 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Kdm5dQ62240 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Kdm5dQ62240 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Kdm5dQ62240 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Kdm5dQ62240 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Kdm5dQ62240 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Kdm5dQ62240 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Kdm5dQ62240 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Kdm5dQ62240 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Kdm5dQ62240 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Kdm5dQ62240 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Kdm5dQ62240 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Kdm5dQ62240 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Kdm5dQ62240 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
Kdm5dQ62240 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Kdm5dQ62240 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Kdm5dQ62240 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Kdm5dQ62240 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Kdm5dQ62240 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Kdm5dQ62240 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Kdm5dQ62240 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC35.76■■■■□ 3.31
Kdm5dQ62240 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Kdm5dQ62240 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Kdm5dQ62240 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Kdm5dQ62240 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Kdm5dQ62240 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Kdm5dQ62240 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
Kdm5dQ62240 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Kdm5dQ62240 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Kdm5dQ62240 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Kdm5dQ62240 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Kdm5dQ62240 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Kdm5dQ62240 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
Kdm5dQ62240 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Kdm5dQ62240 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Kdm5dQ62240 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Kdm5dQ62240 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Kdm5dQ62240 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Kdm5dQ62240 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Kdm5dQ62240 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Kdm5dQ62240 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Kdm5dQ62240 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
Kdm5dQ62240 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Kdm5dQ62240 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Kdm5dQ62240 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Kdm5dQ62240 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Kdm5dQ62240 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Kdm5dQ62240 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Kdm5dQ62240 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
Kdm5dQ62240 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
Kdm5dQ62240 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Kdm5dQ62240 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms