Protein–RNA interactions for Protein: Q62179

Sema4b, Semaphorin-4B, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4bQ62179 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema4bQ62179 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema4bQ62179 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema4bQ62179 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema4bQ62179 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema4bQ62179 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema4bQ62179 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema4bQ62179 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema4bQ62179 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema4bQ62179 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema4bQ62179 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema4bQ62179 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema4bQ62179 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema4bQ62179 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema4bQ62179 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema4bQ62179 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema4bQ62179 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema4bQ62179 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema4bQ62179 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema4bQ62179 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema4bQ62179 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema4bQ62179 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema4bQ62179 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema4bQ62179 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema4bQ62179 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema4bQ62179 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema4bQ62179 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema4bQ62179 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema4bQ62179 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema4bQ62179 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema4bQ62179 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema4bQ62179 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema4bQ62179 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema4bQ62179 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema4bQ62179 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema4bQ62179 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema4bQ62179 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema4bQ62179 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema4bQ62179 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema4bQ62179 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema4bQ62179 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema4bQ62179 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema4bQ62179 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema4bQ62179 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema4bQ62179 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema4bQ62179 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema4bQ62179 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema4bQ62179 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema4bQ62179 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema4bQ62179 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema4bQ62179 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema4bQ62179 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema4bQ62179 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema4bQ62179 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema4bQ62179 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema4bQ62179 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema4bQ62179 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema4bQ62179 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema4bQ62179 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema4bQ62179 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sema4bQ62179 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sema4bQ62179 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sema4bQ62179 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sema4bQ62179 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema4bQ62179 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema4bQ62179 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema4bQ62179 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema4bQ62179 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema4bQ62179 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema4bQ62179 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema4bQ62179 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema4bQ62179 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema4bQ62179 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema4bQ62179 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema4bQ62179 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sema4bQ62179 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sema4bQ62179 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sema4bQ62179 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sema4bQ62179 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Sema4bQ62179 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Sema4bQ62179 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sema4bQ62179 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sema4bQ62179 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sema4bQ62179 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sema4bQ62179 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sema4bQ62179 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sema4bQ62179 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sema4bQ62179 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sema4bQ62179 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sema4bQ62179 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sema4bQ62179 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sema4bQ62179 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Sema4bQ62179 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sema4bQ62179 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sema4bQ62179 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sema4bQ62179 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sema4bQ62179 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sema4bQ62179 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sema4bQ62179 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sema4bQ62179 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms