Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms