Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ctr9Q62018 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctr9Q62018 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctr9Q62018 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctr9Q62018 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctr9Q62018 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctr9Q62018 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctr9Q62018 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctr9Q62018 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctr9Q62018 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctr9Q62018 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctr9Q62018 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctr9Q62018 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctr9Q62018 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctr9Q62018 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctr9Q62018 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctr9Q62018 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctr9Q62018 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctr9Q62018 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctr9Q62018 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctr9Q62018 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctr9Q62018 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctr9Q62018 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms