Protein–RNA interactions for Protein: Q61718

Ifna15, Alpha-interferon, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna15Q61718 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna15Q61718 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna15Q61718 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna15Q61718 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna15Q61718 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna15Q61718 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna15Q61718 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna15Q61718 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna15Q61718 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna15Q61718 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna15Q61718 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna15Q61718 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna15Q61718 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ifna15Q61718 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ifna15Q61718 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ifna15Q61718 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ifna15Q61718 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ifna15Q61718 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ifna15Q61718 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ifna15Q61718 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna15Q61718 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms