Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gli3Q61602 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gli3Q61602 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gli3Q61602 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gli3Q61602 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gli3Q61602 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Gli3Q61602 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gli3Q61602 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gli3Q61602 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Gli3Q61602 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gli3Q61602 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gli3Q61602 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gli3Q61602 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gli3Q61602 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gli3Q61602 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gli3Q61602 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gli3Q61602 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gli3Q61602 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gli3Q61602 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gli3Q61602 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gli3Q61602 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gli3Q61602 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gli3Q61602 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gli3Q61602 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gli3Q61602 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gli3Q61602 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gli3Q61602 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gli3Q61602 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Gli3Q61602 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gli3Q61602 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gli3Q61602 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gli3Q61602 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gli3Q61602 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gli3Q61602 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Gli3Q61602 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.01■■□□□ 1.76
Gli3Q61602 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gli3Q61602 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gli3Q61602 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gli3Q61602 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gli3Q61602 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gli3Q61602 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gli3Q61602 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gli3Q61602 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gli3Q61602 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gli3Q61602 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Gli3Q61602 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Gli3Q61602 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gli3Q61602 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Gli3Q61602 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gli3Q61602 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gli3Q61602 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gli3Q61602 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gli3Q61602 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gli3Q61602 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gli3Q61602 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gli3Q61602 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gli3Q61602 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gli3Q61602 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gli3Q61602 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gli3Q61602 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gli3Q61602 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gli3Q61602 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gli3Q61602 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gli3Q61602 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gli3Q61602 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gli3Q61602 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Gli3Q61602 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gli3Q61602 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gli3Q61602 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gli3Q61602 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gli3Q61602 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gli3Q61602 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gli3Q61602 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gli3Q61602 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gli3Q61602 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gli3Q61602 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gli3Q61602 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gli3Q61602 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gli3Q61602 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gli3Q61602 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gli3Q61602 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gli3Q61602 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gli3Q61602 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gli3Q61602 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gli3Q61602 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gli3Q61602 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Gli3Q61602 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Gli3Q61602 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Gli3Q61602 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gli3Q61602 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gli3Q61602 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gli3Q61602 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gli3Q61602 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gli3Q61602 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gli3Q61602 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gli3Q61602 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gli3Q61602 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gli3Q61602 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gli3Q61602 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gli3Q61602 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms