Protein–RNA interactions for Protein: Q61526

Erbb3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erbb3Q61526 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Erbb3Q61526 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Erbb3Q61526 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Erbb3Q61526 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Erbb3Q61526 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Erbb3Q61526 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Erbb3Q61526 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Erbb3Q61526 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Erbb3Q61526 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Erbb3Q61526 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Erbb3Q61526 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Erbb3Q61526 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Erbb3Q61526 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Erbb3Q61526 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Erbb3Q61526 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Erbb3Q61526 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Erbb3Q61526 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Erbb3Q61526 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Erbb3Q61526 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Erbb3Q61526 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Erbb3Q61526 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Erbb3Q61526 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Erbb3Q61526 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Erbb3Q61526 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Erbb3Q61526 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Erbb3Q61526 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Erbb3Q61526 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Erbb3Q61526 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Erbb3Q61526 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Erbb3Q61526 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Erbb3Q61526 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Erbb3Q61526 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Erbb3Q61526 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Erbb3Q61526 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Erbb3Q61526 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Erbb3Q61526 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Erbb3Q61526 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Erbb3Q61526 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Erbb3Q61526 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Erbb3Q61526 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Erbb3Q61526 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Erbb3Q61526 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Erbb3Q61526 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Erbb3Q61526 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Erbb3Q61526 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Erbb3Q61526 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Erbb3Q61526 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Erbb3Q61526 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Erbb3Q61526 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Erbb3Q61526 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Erbb3Q61526 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Erbb3Q61526 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Erbb3Q61526 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms