Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccne1Q61457 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccne1Q61457 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccne1Q61457 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccne1Q61457 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccne1Q61457 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccne1Q61457 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccne1Q61457 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccne1Q61457 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccne1Q61457 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccne1Q61457 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccne1Q61457 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccne1Q61457 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccne1Q61457 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccne1Q61457 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccne1Q61457 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccne1Q61457 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccne1Q61457 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccne1Q61457 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccne1Q61457 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccne1Q61457 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccne1Q61457 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccne1Q61457 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccne1Q61457 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccne1Q61457 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccne1Q61457 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccne1Q61457 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccne1Q61457 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccne1Q61457 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccne1Q61457 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccne1Q61457 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccne1Q61457 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccne1Q61457 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccne1Q61457 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccne1Q61457 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccne1Q61457 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccne1Q61457 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccne1Q61457 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccne1Q61457 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccne1Q61457 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccne1Q61457 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccne1Q61457 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccne1Q61457 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccne1Q61457 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccne1Q61457 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccne1Q61457 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccne1Q61457 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccne1Q61457 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccne1Q61457 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccne1Q61457 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccne1Q61457 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccne1Q61457 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccne1Q61457 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccne1Q61457 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccne1Q61457 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccne1Q61457 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccne1Q61457 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccne1Q61457 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccne1Q61457 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccne1Q61457 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccne1Q61457 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccne1Q61457 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccne1Q61457 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccne1Q61457 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccne1Q61457 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccne1Q61457 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccne1Q61457 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccne1Q61457 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccne1Q61457 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccne1Q61457 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccne1Q61457 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccne1Q61457 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccne1Q61457 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccne1Q61457 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccne1Q61457 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccne1Q61457 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccne1Q61457 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccne1Q61457 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccne1Q61457 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccne1Q61457 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccne1Q61457 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccne1Q61457 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccne1Q61457 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccne1Q61457 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccne1Q61457 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccne1Q61457 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccne1Q61457 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccne1Q61457 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccne1Q61457 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccne1Q61457 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccne1Q61457 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccne1Q61457 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccne1Q61457 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccne1Q61457 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccne1Q61457 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccne1Q61457 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccne1Q61457 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccne1Q61457 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccne1Q61457 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccne1Q61457 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms