Protein–RNA interactions for Protein: Q61011

Gnb3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb3Q61011 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gnb3Q61011 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Gnb3Q61011 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gnb3Q61011 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gnb3Q61011 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gnb3Q61011 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gnb3Q61011 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gnb3Q61011 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnb3Q61011 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnb3Q61011 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnb3Q61011 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnb3Q61011 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnb3Q61011 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnb3Q61011 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnb3Q61011 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnb3Q61011 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnb3Q61011 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnb3Q61011 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnb3Q61011 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnb3Q61011 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnb3Q61011 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnb3Q61011 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnb3Q61011 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnb3Q61011 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnb3Q61011 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms