Protein–RNA interactions for Protein: Q60989

Xiap, E3 ubiquitin-protein ligase XIAP, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XiapQ60989 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
XiapQ60989 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
XiapQ60989 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
XiapQ60989 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
XiapQ60989 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
XiapQ60989 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
XiapQ60989 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
XiapQ60989 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
XiapQ60989 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
XiapQ60989 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
XiapQ60989 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
XiapQ60989 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
XiapQ60989 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
XiapQ60989 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
XiapQ60989 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
XiapQ60989 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
XiapQ60989 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
XiapQ60989 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
XiapQ60989 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
XiapQ60989 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
XiapQ60989 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
XiapQ60989 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
XiapQ60989 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
XiapQ60989 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
XiapQ60989 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
XiapQ60989 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
XiapQ60989 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
XiapQ60989 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
XiapQ60989 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
XiapQ60989 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
XiapQ60989 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
XiapQ60989 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
XiapQ60989 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
XiapQ60989 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
XiapQ60989 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
XiapQ60989 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
XiapQ60989 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
XiapQ60989 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
XiapQ60989 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
XiapQ60989 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
XiapQ60989 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
XiapQ60989 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
XiapQ60989 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
XiapQ60989 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
XiapQ60989 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
XiapQ60989 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
XiapQ60989 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
XiapQ60989 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
XiapQ60989 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
XiapQ60989 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
XiapQ60989 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
XiapQ60989 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
XiapQ60989 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
XiapQ60989 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
XiapQ60989 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
XiapQ60989 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
XiapQ60989 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
XiapQ60989 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
XiapQ60989 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
XiapQ60989 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
XiapQ60989 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
XiapQ60989 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
XiapQ60989 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
XiapQ60989 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
XiapQ60989 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
XiapQ60989 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
XiapQ60989 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
XiapQ60989 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
XiapQ60989 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
XiapQ60989 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
XiapQ60989 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
XiapQ60989 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
XiapQ60989 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
XiapQ60989 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
XiapQ60989 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
XiapQ60989 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
XiapQ60989 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
XiapQ60989 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
XiapQ60989 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
XiapQ60989 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
XiapQ60989 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
XiapQ60989 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
XiapQ60989 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
XiapQ60989 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
XiapQ60989 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
XiapQ60989 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
XiapQ60989 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
XiapQ60989 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
XiapQ60989 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
XiapQ60989 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
XiapQ60989 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
XiapQ60989 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
XiapQ60989 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
XiapQ60989 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
XiapQ60989 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
XiapQ60989 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
XiapQ60989 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
XiapQ60989 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
XiapQ60989 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
XiapQ60989 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms