Protein–RNA interactions for Protein: Q60961

Laptm4a, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Laptm4aQ60961 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Laptm4aQ60961 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms