Protein–RNA interactions for Protein: Q60932

Vdac1, Voltage-dependent anion-selective channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vdac1Q60932 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vdac1Q60932 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vdac1Q60932 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vdac1Q60932 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vdac1Q60932 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vdac1Q60932 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vdac1Q60932 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vdac1Q60932 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vdac1Q60932 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vdac1Q60932 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vdac1Q60932 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vdac1Q60932 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vdac1Q60932 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vdac1Q60932 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vdac1Q60932 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vdac1Q60932 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vdac1Q60932 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vdac1Q60932 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vdac1Q60932 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vdac1Q60932 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vdac1Q60932 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vdac1Q60932 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vdac1Q60932 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vdac1Q60932 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vdac1Q60932 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vdac1Q60932 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vdac1Q60932 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vdac1Q60932 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vdac1Q60932 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vdac1Q60932 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vdac1Q60932 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vdac1Q60932 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vdac1Q60932 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vdac1Q60932 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vdac1Q60932 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vdac1Q60932 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vdac1Q60932 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vdac1Q60932 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vdac1Q60932 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vdac1Q60932 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vdac1Q60932 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vdac1Q60932 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vdac1Q60932 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vdac1Q60932 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vdac1Q60932 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vdac1Q60932 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vdac1Q60932 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vdac1Q60932 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vdac1Q60932 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vdac1Q60932 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vdac1Q60932 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms