Protein–RNA interactions for Protein: Q60790

Rasa3, Ras GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasa3Q60790 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rasa3Q60790 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rasa3Q60790 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rasa3Q60790 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rasa3Q60790 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rasa3Q60790 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rasa3Q60790 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rasa3Q60790 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rasa3Q60790 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rasa3Q60790 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rasa3Q60790 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rasa3Q60790 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rasa3Q60790 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rasa3Q60790 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rasa3Q60790 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rasa3Q60790 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rasa3Q60790 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rasa3Q60790 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rasa3Q60790 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rasa3Q60790 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rasa3Q60790 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rasa3Q60790 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rasa3Q60790 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rasa3Q60790 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rasa3Q60790 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rasa3Q60790 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rasa3Q60790 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rasa3Q60790 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rasa3Q60790 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rasa3Q60790 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rasa3Q60790 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rasa3Q60790 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rasa3Q60790 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rasa3Q60790 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rasa3Q60790 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rasa3Q60790 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rasa3Q60790 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rasa3Q60790 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rasa3Q60790 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rasa3Q60790 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rasa3Q60790 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rasa3Q60790 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rasa3Q60790 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rasa3Q60790 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rasa3Q60790 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rasa3Q60790 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rasa3Q60790 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rasa3Q60790 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rasa3Q60790 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rasa3Q60790 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rasa3Q60790 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rasa3Q60790 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rasa3Q60790 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rasa3Q60790 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rasa3Q60790 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rasa3Q60790 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rasa3Q60790 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rasa3Q60790 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rasa3Q60790 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rasa3Q60790 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rasa3Q60790 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rasa3Q60790 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rasa3Q60790 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rasa3Q60790 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rasa3Q60790 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rasa3Q60790 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rasa3Q60790 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rasa3Q60790 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rasa3Q60790 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rasa3Q60790 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rasa3Q60790 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rasa3Q60790 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rasa3Q60790 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rasa3Q60790 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rasa3Q60790 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rasa3Q60790 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rasa3Q60790 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rasa3Q60790 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rasa3Q60790 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rasa3Q60790 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rasa3Q60790 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rasa3Q60790 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rasa3Q60790 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rasa3Q60790 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rasa3Q60790 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rasa3Q60790 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rasa3Q60790 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rasa3Q60790 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rasa3Q60790 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rasa3Q60790 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rasa3Q60790 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rasa3Q60790 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rasa3Q60790 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rasa3Q60790 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rasa3Q60790 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rasa3Q60790 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rasa3Q60790 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Rasa3Q60790 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rasa3Q60790 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rasa3Q60790 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms