Protein–RNA interactions for Protein: Q60778

Nfkbib, NF-kappa-B inhibitor beta, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbibQ60778 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NfkbibQ60778 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NfkbibQ60778 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NfkbibQ60778 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NfkbibQ60778 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NfkbibQ60778 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NfkbibQ60778 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NfkbibQ60778 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NfkbibQ60778 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NfkbibQ60778 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NfkbibQ60778 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NfkbibQ60778 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NfkbibQ60778 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NfkbibQ60778 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NfkbibQ60778 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms