Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprnQ60673 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprnQ60673 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprnQ60673 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprnQ60673 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprnQ60673 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprnQ60673 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprnQ60673 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprnQ60673 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprnQ60673 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprnQ60673 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprnQ60673 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprnQ60673 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprnQ60673 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprnQ60673 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprnQ60673 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprnQ60673 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprnQ60673 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprnQ60673 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprnQ60673 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprnQ60673 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprnQ60673 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprnQ60673 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprnQ60673 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprnQ60673 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprnQ60673 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprnQ60673 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprnQ60673 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprnQ60673 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprnQ60673 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprnQ60673 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprnQ60673 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprnQ60673 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprnQ60673 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprnQ60673 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprnQ60673 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprnQ60673 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprnQ60673 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprnQ60673 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprnQ60673 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprnQ60673 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprnQ60673 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprnQ60673 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprnQ60673 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprnQ60673 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprnQ60673 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprnQ60673 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprnQ60673 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprnQ60673 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprnQ60673 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprnQ60673 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprnQ60673 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprnQ60673 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprnQ60673 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprnQ60673 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprnQ60673 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprnQ60673 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprnQ60673 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprnQ60673 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprnQ60673 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprnQ60673 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprnQ60673 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprnQ60673 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprnQ60673 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprnQ60673 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms