Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sik1Q60670 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Sik1Q60670 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sik1Q60670 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sik1Q60670 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sik1Q60670 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sik1Q60670 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sik1Q60670 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sik1Q60670 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sik1Q60670 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sik1Q60670 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sik1Q60670 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sik1Q60670 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Sik1Q60670 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sik1Q60670 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sik1Q60670 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sik1Q60670 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sik1Q60670 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sik1Q60670 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sik1Q60670 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sik1Q60670 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sik1Q60670 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sik1Q60670 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sik1Q60670 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sik1Q60670 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sik1Q60670 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sik1Q60670 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sik1Q60670 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sik1Q60670 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sik1Q60670 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sik1Q60670 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sik1Q60670 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sik1Q60670 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sik1Q60670 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sik1Q60670 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sik1Q60670 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sik1Q60670 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Sik1Q60670 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sik1Q60670 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sik1Q60670 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sik1Q60670 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sik1Q60670 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sik1Q60670 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sik1Q60670 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Sik1Q60670 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sik1Q60670 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sik1Q60670 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sik1Q60670 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sik1Q60670 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sik1Q60670 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sik1Q60670 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sik1Q60670 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sik1Q60670 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Sik1Q60670 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sik1Q60670 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sik1Q60670 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sik1Q60670 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sik1Q60670 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sik1Q60670 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sik1Q60670 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Sik1Q60670 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sik1Q60670 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sik1Q60670 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sik1Q60670 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sik1Q60670 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sik1Q60670 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sik1Q60670 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sik1Q60670 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Sik1Q60670 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Sik1Q60670 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sik1Q60670 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sik1Q60670 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Sik1Q60670 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sik1Q60670 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sik1Q60670 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sik1Q60670 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sik1Q60670 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sik1Q60670 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sik1Q60670 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sik1Q60670 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sik1Q60670 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sik1Q60670 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sik1Q60670 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sik1Q60670 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sik1Q60670 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sik1Q60670 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sik1Q60670 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sik1Q60670 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sik1Q60670 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sik1Q60670 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sik1Q60670 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sik1Q60670 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sik1Q60670 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sik1Q60670 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sik1Q60670 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sik1Q60670 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sik1Q60670 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sik1Q60670 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sik1Q60670 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Sik1Q60670 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms