Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 1,040 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms