Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3K5

Rabl6, Rab-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl6Q5U3K5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rabl6Q5U3K5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rabl6Q5U3K5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rabl6Q5U3K5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rabl6Q5U3K5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rabl6Q5U3K5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rabl6Q5U3K5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rabl6Q5U3K5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rabl6Q5U3K5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rabl6Q5U3K5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rabl6Q5U3K5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rabl6Q5U3K5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rabl6Q5U3K5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rabl6Q5U3K5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rabl6Q5U3K5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rabl6Q5U3K5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rabl6Q5U3K5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rabl6Q5U3K5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rabl6Q5U3K5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rabl6Q5U3K5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rabl6Q5U3K5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rabl6Q5U3K5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rabl6Q5U3K5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rabl6Q5U3K5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rabl6Q5U3K5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rabl6Q5U3K5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rabl6Q5U3K5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rabl6Q5U3K5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rabl6Q5U3K5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rabl6Q5U3K5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rabl6Q5U3K5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rabl6Q5U3K5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rabl6Q5U3K5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rabl6Q5U3K5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rabl6Q5U3K5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rabl6Q5U3K5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rabl6Q5U3K5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rabl6Q5U3K5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rabl6Q5U3K5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rabl6Q5U3K5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rabl6Q5U3K5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rabl6Q5U3K5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rabl6Q5U3K5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rabl6Q5U3K5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rabl6Q5U3K5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rabl6Q5U3K5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rabl6Q5U3K5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rabl6Q5U3K5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rabl6Q5U3K5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rabl6Q5U3K5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rabl6Q5U3K5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rabl6Q5U3K5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rabl6Q5U3K5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rabl6Q5U3K5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rabl6Q5U3K5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rabl6Q5U3K5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rabl6Q5U3K5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rabl6Q5U3K5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rabl6Q5U3K5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rabl6Q5U3K5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rabl6Q5U3K5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rabl6Q5U3K5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms