Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms