Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms