Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSH7

Zzef1, Zinc finger ZZ-type and EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,924 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zzef1Q5SSH7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zzef1Q5SSH7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zzef1Q5SSH7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zzef1Q5SSH7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zzef1Q5SSH7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zzef1Q5SSH7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zzef1Q5SSH7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zzef1Q5SSH7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Zzef1Q5SSH7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zzef1Q5SSH7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zzef1Q5SSH7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zzef1Q5SSH7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zzef1Q5SSH7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zzef1Q5SSH7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zzef1Q5SSH7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Zzef1Q5SSH7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zzef1Q5SSH7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zzef1Q5SSH7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Zzef1Q5SSH7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zzef1Q5SSH7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zzef1Q5SSH7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zzef1Q5SSH7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zzef1Q5SSH7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Zzef1Q5SSH7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zzef1Q5SSH7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Zzef1Q5SSH7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Zzef1Q5SSH7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Zzef1Q5SSH7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms