Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSF7

Fam46c, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, mousemouse

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam46cQ5SSF7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms